深圳市中医肛肠医院由深圳市非物质文化遗产“杜氏肛肠”第四代传承人杜克义先生创办于1998年，是深圳市唯—一家公立肛肠专科医院，也是国内规模最大的肛肠专科医院之一。历经二十余载的砥砺前行，现已发展成为中华中医药学会首批(中国)肛肠医师诊治能力提升计划推广中心、深圳市中医肛肠疾病诊疗中心，是世界中医药学会联合会外科专业委员会、世界中医药学会联合会盆底医学专业委员会、白求恩精神研究会肛肠分会、中国民族医药学会肛肠分会、中国民间中医药研究开发协会肛肠分会副会长单位，也是广东省医师协会中西医肛肠医师分会副主任委员及深圳市医师协会肛肠科医师分会、深圳市中医药学会盆底医学专业委员会、深圳市健康管理协会肛肠专业委员会会长单位。
医院致力于融合传统中医的智慧与现代医学的精准，为患者提供个性化、优质的治疗方案。医院建筑面积7万余平方米，现有床位420张(实际开放300张),职工350余人，其中享受国务院政府特殊津贴的专家1人，国家卫生健康技术推广传承应用项目传承人1人，省、市级名中医2人，研究生导师7人，在国家级、省市级学(协)会担任副主委以上职务者5人，“白求恩式好医生”1人。有高级职称专家36人，博士13人，医生中硕士研究生学历以上占比84%。医院现设肛肠外科、综合外科、综合内科、脾胃病科、针推康复科、重症医学科等11个病区。目前，医院挂牌“岭南肛肠学院深圳分院”“陕西中医药大学硕士联合培养基地”“陕西中医药大学深圳研究院”“注射疗法华南培训中心”“邵万金盆底外科专科医生培训基地”“全国名老中医药专家丁义江传承工作室”“张燕生首都名中医工作室”“梁靖华国家卫生健康技术推广传承应用项目传承室”“广东省名中医传承工作室”“邵万金名医工作室”,2024年12月深圳市中医药高层次医学团队“医疗卫生三名工程”正式立项，丁义江南京市中医院肛肠科团队入驻我院［丁义江，博士研究生导师，全国中医肛肠专科医疗中心主任，国家级中医肛肠学会名誉主任委员兼省中医肛肠学会主任委员，享受国务院政府特殊津贴，“中医诊疗法(丁氏痔科医术)”入选国家级非物质文化遗产］。
现有广东省重点专科、广东省特色专科、深圳市中医特色专科、福田区临床重点专科各1个。有全国著名肛肠外科专家梁靖华教授、邵万金教授等组成的专业技术团队，医院独创的婴幼儿肛周脓肿一次性根治术、复杂性肛瘘肛腺切除并桥式引流术、直肠推移瓣修补术(直肠阴道瘘)、Bascom臀沟抬高术、Lift、Tropis、STARR等术式，具有“损伤少、痛苦小、恢复快”的优点，深受患者好评。其中婴幼儿肛周感染性疾病、盆底肛肠疾病省外就诊率均超过50%,深圳市以外就诊率均超过80%。自制中药熏洗、直肠滴灌等特色疗法及中药湿痒洗剂、紫金消肿洗液、婴幼儿肛肠洗剂等院内特色制剂，疗效显著。在2019-2024年深圳市医疗行业服务公众满意度调查监测中，患者公众满意度均位列深圳同级别医院前茅，群众口碑良好。
医院拥有西门子3.0T核磁共振、联影256排和64排螺旋CT、高档四维盆底和心血管彩超、平板胃肠机、DR、超高清腹腔镜、超声内镜、高清电子胃肠镜系统、磁控胶囊式内窥镜系统、消化内镜能量平台、罗氏生化免疫流水线、贝克曼全自动生化发光仪、瑞士帝肯全自动酶免分析仪等先进影像和检验医疗设备，以及盆底肌电图、肛门直肠动力仪、心电图机、洗肠机、生物反馈磁疗机、高频肛肠治疗仪、生物刺激反馈仪等一批先进的肛肠盆底设备，还拥有10间层流净化手术室、12套ICU中央监护设备以及其他先进的病理类、麻醉监护类设备，医院目前万元以上设备达390台(套),总价值达到1.5亿元。
征途漫漫，唯有奋斗。深圳市中医肛肠医院将以新院建设为契机，不断提高服务质量，改善服务态度，在中国深圳这片沃土上，以拓荒牛的精神，肛肠人的智慧，不断进取，将我院建设成为中西医并重，中医药特色优势明显，重点专科优势突出，医、教、研同步发展的三级甲等肛肠医院，成为全国肛肠医院中一颗耀眼的明珠。