百年协和，源远流长。福建医科大学附属协和医院前身是福建基督教协和医院（又名Wilis F. Pierce MemorialHospital），为创建于1860年的福州圣教医院与创建于1877年的福州马高爱医院合并而成，为八闽现代医学的发祥地。现已成为一所集医疗、教学、科研、预防和保健为一体的大型三级甲等综合性医院。医院坐落在福州市中心风景秀丽的于山之麓，现有床位2500张，年门诊病人近200万人次，年收治住院病人11万余人次，开展各类手术10万余台（其中住院部Ⅲ、Ⅳ级手术达70）。现有员工3700余人。其中正、副高职称（含教授、副教授）500余人。拥有、省部级、享受政府特殊津贴专家等高层次人才百余名。除院本部外，还拥有福建医科大学附属第三医院（协和医院西院）、福建医科大学附属平潭协和医院（协和医院平潭分院）两个院区，本部编制床位2500张。
医院综合实力雄厚，跻身“全国医院综合实力百强榜”“中国医院科技影响力百强榜”“中国医院竞争力•医院百强榜”，为福建省高水平医院、国家首批疑难病症诊治能力提升工程建设项目单位。拥有6个国家临床重点专科、4个福建省医学中心、12个福建省临床重点专科和8个福建医科大学首批重点学科。开展大量新技术、新项目，同种异体心脏移植手术（心脏移植后再次成功移植心脏、儿童心脏移植）、心脏移植后的肝移植、双肺移植、异基因造血干细胞移植治疗白血病、运用三分支支架血管技术治疗急性主动脉夹层、经皮（或经心尖）导管主动脉瓣人工瓣膜置入术、复杂冠脉分叉病变的介入治疗、结直肠癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、肺癌等恶性肿瘤的微创治疗、“中国式换脸”、神经调控技术治疗帕金森病及运动障碍疾病、基于射波刀的肿瘤运动跟踪及立体定向放疗等技术，在业界具有较大影响力。
福建省血液病、内分泌、肝胆外科、胸心外科等11个省级研究所及其他11个校级研究机构挂靠医院。承担大量国家、省、部级科研项目，先后获得3项国家科技进步奖、国家自然科学奖，430余项省、部级等科研成果奖。协和临床医学院承担福建医科大学各相关专业的临床教学任务，福建省早的临床医学博士、硕士点发端于我院，是国家临床教学培训示范中心、住院医师、专科医师规范化培训基地、中国医师协会腹腔镜外科医师培训基地。
医院拥有包括内窥镜手术器械控制系统（达芬奇手术机器人）、X线立体定向放射治疗系统（射波刀）、革命型CT、宝石能谱CT、Prisma磁共振、PET-CT、全飞秒激光和准分子屈光手术系统等在内的一大批国际先进医疗设备。目前医院基本实现信息化管理及后勤服务社会化。
医院重视“两个文明”建设，加强职业道德教育，努力提高医疗服务质量，1994年被卫生部评为福建省首批“三级甲等医院”，三度获评“全国卫生计生系统先进集体”称号，被授予“全国创建‘以病人为中心，优质服务’百佳医院”称号。医院全体医务人员秉承“严谨、求精、勤奋、奉献”的协和精神以及“服务是基础，医德是根本，质量是生命”的办院理念，协同八方、和成天下，竭诚为海内外人民的健康提供一流服务