南方医科大学深圳口腔医院（坪山）（深圳市第二口腔医院）是2017年12月28日，深圳市卫生健康委员会（原深圳市医管中心）、南方医科大学、坪山区人民政府签署三方协议，合作运营的市属公立口腔专科医院（深圳市医保定点单位）、南方医科大学直属附属医院。

医院定位为“立足深圳、服务粤港澳大湾区、辐射东南亚，集医疗、教学、研究与产业孵化转化为一体的国内一流、国际先进的综合性高水平口腔医疗基地”。

医院位于深圳市坪山区东纵路143号，地铁16号线东纵站（在建）出口，总规划床位100张，牙椅300台，按“总体规划 分步实施”原则，分两期建设。一期占地面积2200㎡，建筑面积11200㎡，设有床位30张，牙椅60台。于2019年12月28日建成启用，并于2020年6月6日试运营。

医院二期占地面积43000㎡，计划设置床位70张，牙椅240台，争取在一期开业5年内建成启用。在一期基础上，整体建成立足深圳、服务粤港澳大湾区、面向海外，集医疗、教学、研究与产业孵化转化为一体的国内一流、国际先进的综合性高水平口腔医疗基地。通过打造、省级和市级临床重点专科，发挥龙头学科的辐射带动作用，推动医院高水平建设。

医院整体作为《深圳市实施东进战略行动方案（2016-2020年）》布局的市级重大医疗卫生工程，按照三级甲等口腔专科医院进行建设，医院目前已开放牙体牙髓病科、牙周粘膜病科、儿童口腔科、口腔修复科、口腔种植科、口腔颌面外科（含住院部）、口腔正畸科等7大业务科室，在依托南方医科大学医疗、教学、科研、管理、人才等优势的同时，结合深圳市区域特点、人口特点，以“数字化微创牙体保存诊疗”“儿童口腔舒适化无痛治疗”“牙齿正颌、正畸、颌面美容修复治疗”作为特色专科发展方向。

医院现有全职聘用员工134人，博士后研究人员9人，柔性引进王松灵院士团队3人、国家杰青1人、多点执业专家1人。全职聘用人员中，本科及以上学历91人（博士9人、硕士44人、本科38人）；卫生技术人员110人（正高7人，副高12人，中级17人）。