南京市第一医院（南京医科大学附属南京医院、中国药科大学南京市第一医院），是原卫生部首批三级甲等综合性医院。医院创建于1936年2月，现有1个主院区和2个分院区（南院和河西院区），在职职工3200人，编制床位2600张，占地面积10.039万㎡，建筑面积20.67万㎡。2021年，医院诊疗253.07万人次，出院8.41万人次。医院设有南京医科大学第三临床医学院、南京市心血管病医院、国家高级卒中中心、国家药物临床试验机构、国家首批心脏移植准入医院、国家首批工伤康复试点机构、国家良性前列腺增生健康管理基地、南京医科大学数字医学研究所等。

医院科室设置完善，现有医学重点学科1个，国家临床重点专科1个，省级医学重点学科4个，南京医科大学重点学科4个，南京医科大学重点学科优选学科1个，江苏省临床重点专科19个，南京市医学重点专科12个，省级创新团队6个，江苏省专科（病）诊疗中心1个。设有博士后科研工作站1个、院士工作站3个。

医院医疗水平精湛，现已成立国家高级卒中中心、省级胸痛救治中心、区域级创伤中心和市级危重孕产妇救治中心，并形成以冠脉分叉病变的介入治疗、肺动脉去神经术、心脏移植技术、微创心脏不停跳搭桥技术、急性缺血性卒中血管再通治疗技术和数字骨科的个性化化诊疗为主的医疗技术特色。2019年，医院被国家卫生健康委脑卒中防治工程委员会授予“五星高级卒中中心”称号，并当选“中国卒中中心培训基地”，全国仅26家，江苏2家。

医院作为南京医科大学第三临床医学院，教学体系完整，设有临床学位分委员会1个，教学督导室1个、教研室20个；现有博士点14个、硕士点30个；博士生导师20人、硕士生导师153人；教授（含兼职）38人、副教授（含兼职）127人。现有含住院医师规范化培训基地在内的培训基地6个、省级培训基地5个。每年在院培养含博士生、硕士生、本科生、进修生、住院医师规范化培训等各类学员1200人。

医院医疗设备先进，拥有百万元以上设备132套，包括：112环数字光导PET-CT、同位素单光子发射计算机断层扫描仪(ECT)、心血管造影系统(DSA)、先进的双源CT、多层面螺旋CT、1.5T和3.0T磁共振断层扫描仪、直线加速器系统、数字化X线成像系统(DR)、高能超声聚焦治疗机、光学干涉断层成像系统和数字化手术室系统等先进设备。

2005年起，医院联合南京市、苏北及安徽地区17家二级医院成立“南京市第一医院集团”；在江苏、安徽、湖北等省各大中型医院建立心脏病、糖尿病、骨科、普外科、康复科、眼科、介入和妇产科等诊疗分中心136个。2014年起，积极开展医联体工作，现已在全市范围内建立医联体40余家，其中紧密型医联体7家，推动医疗卫生资源下沉，构建分级诊疗服务新模式。2002年，通过英国BSI太平洋公司医院ISO9001质量管理体系认证；2013年，医院在全省范围内通过英国保柏集团的“管理质量服务(MQS)”银级认可。2019年，通过江苏省卫生统计信息中心现场测试，符合互联网医院基本标准。

医院先后获得“全国文明单位”“节约型公共机构示范单位”“示范高级卒中中心”“全国援外医疗工作先进集体”“中国医学科学抗疫先进医疗队”和“江苏省先进基层党组织”等荣誉称号。