宝安区慢性病防治院成立于1987年，起源于宝安县慢性病防治站，原址位于宝安区36区（宝安公园旁），2003年4月更为现名，2012年10月整体搬迁至宝安区西乡街道文卫路99号（平峦山公园），2018年9月实行防保、临床业务分离、人员分流改革，2019年7月搬迁至宝安区裕安二路332号运营办公。2015年经区编办批准加挂宝安区精神卫生中心，2023年6月加挂宝安区老年健康指导中心，目前为三块牌子一套人马，行政管理岗位为七级，财政全额保障，为公益性公共卫生服务机构。

　　目前内设12个科室，分别为：办公室、计财科、总务设备科、业务管理科（基本公共卫生项目办）、结核病防制科、性病麻风病防制科、健康管理科、慢性病综合防制科、精神卫生科、实验室、信息科、健康教育与促进科。慢性病防治为区级重点学科。为中山大学、暨南大学研究生实践培养基地，山西医科大学、中南大学、广东药科大学预防医学专业本科教育实习基地。

　　2025年9月止，在岗工作人员94人，其中事业编制人员70人，聘用人员24人。卫生专业技术人员79人，其中高级职称19人，中级职称32人。博士研究生4人，硕士研究生47人，本科29人。

　　主要承担宝安区的慢性传染性疾病（结核病、性病、麻风病）、慢性非传染性疾病（高血压、糖尿病、恶性肿瘤、脑卒中、急性心肌梗死、伤害监测、慢阻肺）、健康档案管理、老年保健、精神卫生（社会心理服务指导、严重精神障碍患者监测与管理）、口腔卫生项目（免费窝沟封闭、儿童口腔疾病干预）和健康教育与促进等职能和工作任务，负责居民健康档案管理、高血压、糖尿病、结核病、精神障碍、老年人管理、慢性阻塞性肺疾病患者管理7项国家基本公共卫生服务项目的业务管理和技术指导工作。区慢病院一直作为国家公共卫生改革（结核病防治重大科技专项、国家慢性病综合防控示范区）的试验田和先行区，在慢性病控制和流动人口健康管理方面积累了丰富经验，成为深圳市公共卫生方面的一张亮丽名片。

　　宝安区慢性病防治院始终遵循“政府主导、多部门协作、专业机构支持、社会广泛参与”的原则，形成了以区慢病院为主导、区内综合医院和区公共卫生服务各分中心为骨干、各社区健康服务中心为网底的“三位一体”慢性病防控机制，探索出一条“健康双工 慢病专业队伍”、“文化春雨行动捆绑”、“免费窝沟封闭进校园”、“健康教育讲师团菜单式服务”等具有宝安特色、“预防-治疗-健康管理”一体化（简称“防治管一体化”）的慢性病防控工作模式，积极构建宝安区国家慢性病综合防控示范区、国家重大科技专项结核病综合防治示范区、国家精神卫生综合管理和社会心理服务试点区的战略发展格局，受到侯云德、李兰娟等院士的好评，为辖区市民的身心健康保驾护航。