医院始建于1958年9月1日，2012年被评为三级甲等综合性中医医院。医院是成都中医药大学非直属附属医院、广州中医药大学教学医院和海南医学院教学医院，是省内东部区域中医药服务中心龙头单位，是胡希恕经方医学琼海传承基地、脉证经方传承基地、心脏康复培训基地、海南省中医类别（含全科）住院医师规范培训基地、中医药健康旅游和服务贸易示范基地建设单位，并拥有岛东地区第一家批准准入人类辅助生殖技术治疗不孕不育症的专业医疗助孕中心。

2020年，琼海市委市政府以琼海市中医院为牵头单位，联合嘉积、中原、阳江、龙江、石壁、会山、文市、东平、南俸、东太等10家基层卫生院（或农垦基层医院）和34家村卫生室组建琼海市中医院紧密型市域医疗卫生共同体。同年，医院通过国家四级电子病历评审。2021年8月，海南省卫生健康委员会确定琼海市中医院中医妇科为省级临床医学中心扶持学科，是全省县级市一家省级临床医学中心建设单位。

医院现有东风路院区和跃华路院区两个院区，现有职工785人，硕士研究生48人，高级职称人数101人。现有第四、五批全国老中医药专家学术经验继承指导老师1名，全国基层名中医2名，海南省名中医1名，海南省“515人才工程”第三层次人选1名，海南省拔尖人才5名，海南乡土人才7名，海南省其他高层次人才77名；海南省“西部之光”访问学者1名。

医院开放床位500张，设有26个临床科室和9个医技科室，拥有省级Ⅰ类中医重点专科6个：妇科、骨伤科、心病科、老年病科、康复科、儿科；省级临床Ⅱ级重点专科3个：普外科、产科、放射科。医院配置直接数字化血管造影系统（DSA）、飞利浦1.5T核磁共振(MRI)、西门子AS128螺旋CT机等医疗设备。开展心血管（省内第二家医院开展经远端桡动脉穿刺冠状动脉内支架置入术）、颅脑、外周介入手术、第一、二代试管婴儿技术、冻融胚胎移植术、多胎妊娠选择性减胎术、髋膝关节置换术、脊柱椎间孔镜手术、关节镜手术、急性心肌梗死及急性脑梗塞静脉溶栓治疗、结肠直肠癌根治术、经尿道前列腺汽化电切术、颅内血肿清除术、妇科恶性肿瘤根治术、胃镜下食管静脉曲张套扎加硬化剂注射治疗术、食管癌金属支架植入术、血液透析、腹膜透析等技术项目。

医院将继续秉承“尊重生命 关爱患者”核心价值观，以人民健康为中心，以建设临床应用研究型的岛东区域性现代化综合性三级甲等中医院为目标，更好地发挥省内东部区域龙头和示范作用，为发展卫生健康事业做出更大的贡献。